Tim znanstvenika iz FER-ovog Laboratorija za bioinformatiku i računalnu biologiju u suradnji s A*STAR Genome Institute of Singapore (GIS) razvili su alat Graphmap. Graphmap je namjenjen analizi dugih očitanja s velikim postotkom pogreške tipičnih za novu tehnologiju sekvenciranja nanoporama i uređaje MinION tvrtke ONT. Prestižni znanstveni časopis Nature Communications donosi da je Graphmap u stanju iskoristiti više od 90% podataka dobivenih iz uređaja MinION.

Područje analiza DNA razvija se izuzetno brzo zahvaljujući dostupnosti novih tehnologija sekvenciranja. Moguće su primjene u raznim područjima - od praćenja i dijagnostike bolesti, poboljšanja uzgoja usjeva do sekvenciranja ljudske DNA u svrhu određivanja terapije prilagođene pojedinoj osobi.

Moguće je zamisliti da ćemo u bliskoj budućnosti pametne telefone moći koristiti za genetsku analizu u svakodnevnom životu, poput uređaja Tricorder iz SF serije Star Trek.

Na radu su (kao prvi koautori) sudjelovali članovi Laboratorija za bioinformatiku i računalnu biologiju: izv. prof. Mile Šikić sa FER-a i Ivan Sović, mag. ing. el. sa Instituta Ruđer Bošković.

Detaljnije o ovom postignuću možete pročitati: OVDJE.

Rad objavljen u časopisu Nature Communications se nalazi: OVDJE.